北京协和医学院是我国现代医学教育的发源地，开启了我国八年制临床医学教育和高等护理学教育的先河。在中国现代医学的各个领域，协和人或成为奠基人，或成为开拓者，在我国医学教育领域具有特殊的地位和独特的社会影响力。我校办学特色鲜明，一直坚持“高进、优教、严出”的培养模式，以培养具有真才实学、学风严谨、医德高尚、医术精湛的医教研复合型人才而闻名，不仅造就了林巧稚、黄家驷、吴阶平等中国医学界的泰斗，还培养了一大批享誉国内外的著名临床医学家、医学科学家、医学教育家、护理学家和医政管理家，在国内外享有很高的声誉。

我校的本科招生共有三个专业：临床医学（八年制）专业、护理专业和药学专业。临床医学（八年制）专业创办于1917年，护理专业本科创办于1920年，两个专业均为国家特色专业建设点，为国家级一流专业。药学专业本科创办于2024年。

临床医学（八年制）专业学制8年，每年招生计划为95人。医学预科阶段在清华大学学习自然科学、社会科学和人文科学课程。医学学习阶段在协和本部学习基础医学和临床医学课程，完成临床实习、科研训练和毕业论文。学生毕业时成绩优秀、符合学位授予规定者可获得医学博士学位。临床医学（八年制）专业的培养坚持“八年一贯制，加强基础，注重技能，强调素质，整体优化，面向临床、科研”的原则，培养思想品德高尚，具有宽厚的人文社会科学、自然科学和医学相关学科知识基础、扎实的临床技能和优秀的职业素养，具有多种发展潜能，追求卓越、引领未来的医学领军人才。

护理学本科专业学制4年，每年招生计划为140人。护理学学生毕业时符合学位授予规定者授予理学学士学位。毕业生成为护理行业的领导及骨干，为推动中国护理事业的建设和发展发挥了重要作用。至今已有9名毕业生获得国际护理学界最高荣誉“南丁格尔奖”，为我国护理院系之冠。

药学本科专业学制4年，为培养高层次、复合型医药行业领军人才，北京协和医学院和北京师范大学从2024年开始联合招收药学专业本科生，每年各招收15人。前2年在北京师范大学开展通识教育和基础课程学习，后2年在北京协和医学院药学院进行药学相关专业课程学习、开展实践和药学研究基础训练。优秀毕业生可通过推免的方式继续深造，成为符合新质生产力发展要求的高素质拔尖型药学专业人才。北京协和医学院药学为国家“双一流”学科，2025 年协和的药理学与毒物学学科进入全球 ESI 万分之一。