为贯彻落实习近平总书记“努力把中国医学科学院建设成为我国医学科技创新体系的核心基地”的重要指示精神，加强对我国医学科技创新体系和核心基地建设的智力支撑，中国医学科学院于 2019 年成立了学术咨询委员会。

学术咨询委员会的主要职责是针对国家医学卫生健康事业发展中的重大问题，特别是国家医学科技创新体系与核心基地建设中的重点、难点问题，研究提出咨询建议；承担中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目的立项咨询、人才队伍建设和发展规划等重大事项的评价评议。受中国医学科学院委托，组织开展国内外学术合作与交流等。学术咨询委员会下设临床医学、口腔、基础医学与生物、药学、卫生健康与环境、生物医学工程与信息六个学部，覆盖医学卫生健康主要科技领域，目前按临床医学 - 口腔、基础医学与生物、药学 - 卫生健康与环境 - 生物医学工程与信息三个学部（群）开展工作，鼓励各位学术咨询委员会学部委员跨学部参加活动。

2019 年，学术咨询委员会创立伊始，首批聘任 191 名中国科学院与中国工程院院士、8 名北京协和医学院“百年协和”一级教授，共计 199 名生物医药领域专家担任学术咨询委员会学部委员。学术咨询委员会创新遴选机制，每两年开展一次学术咨询委员会学部委员选聘工作，逢双数年进行。目前，中国医学科学院学术咨询委员会学术咨询委员会学部委员数量达到 276 名，其中两院院士 231 名。

中国医学科学院学术咨询委员会成立以来，全体学术咨询委员会学部委员积极参与建设，每年组织召开中国医学发展大会，设立“由心讲堂”高端学术交流平台，发布中国 21 世纪重要医学成就及中国年度重要医学进展，开展学术咨询，积极承担国家医学科技创新体系建设和人才培养等战略谋划工作，国家医学卫生健康领域高端智库的作用初步显现。