历任校长

麦克林( Franklin C.Mclean ) 1918-1919

胡恒德( Henry S.Houghton ) 美国人 1920-1928 1938-1942

顾临( RogerS.Greene ) 1928-1938 中华医学基金会驻华代表 (代理校长)

刘瑞恒 1929-1938 我国第一位毕业于美国哈佛大学的医学博士， 协和医学院第一位中国人校长

李宗恩 1947-1957

历任院校长

沈其震 1956－1958 著名医学专家,一级教授,中国科学院学部委员

黄家驷 1959－1983 著名胸外科专家，中国科学院学部委员，一级教授

吴阶平 1983－1984 著名泌尿外科专家，中国科学院学部委员，一级教授

顾方舟 1985－1992 病毒学教授，六十年代初成功研制脊髓灰质炎口服活疫苗

巴德年 1992－2001 免疫学教授，中国工程院院士

历任党委书记

张之强 1952-1965

白希清 1966

杨 纯 1976-1978

王 伟 1978-1979

林士笑 1979-1982

冯佩之 1983-1984

钱昌年 1986-1998

刘晓程 1998-2000

祁国明 2000-2001

刘谦 2001-2007